標題：我國創(chuàng)新基因大模型SYMPLEX引領全球，開啟基因挖掘新時代
隨著生物技術的飛速發(fā)展，全球天然基因庫已經(jīng)積累了數(shù)十億量級的序列，蘊藏著海量高價值功能基因。然而，當前僅有少數(shù)明星基因被深度挖掘，絕大多數(shù)仍處于“沉睡”狀態(tài)。在這個基因挖掘的藍海市場中，我國科研團隊的創(chuàng)新基因大模型SYMPLEX正在引領全球，開啟基因挖掘新時代。
SYMPLEX是一種面向合成生物學元件挖掘與生物制造應用的大語言模型，通過融合領域大語言模型訓練、合成生物專家知識對齊和大規(guī)模生物信息分析，實現(xiàn)了從海量文獻中自動化挖掘功能基因元件，并精準評估其工程化應用潛力。這一創(chuàng)新性的研究成果，不僅展示了大語言模型賦能生物制造的巨大潛力，也揭示了基因挖掘的新方向。
SYMPLEX在mRNA疫苗生物制造關鍵酶——加帽酶的挖掘中取得了顯著成果。第三方公司實驗驗證顯示，其獲得的酶在催化效率上超越了國際頭部企業(yè)New England Biolabs（NEB）商業(yè)化加帽酶2倍以上，顯著提升了mRNA疫苗生產(chǎn)率和成本效益。這一突破性的成果不僅為生物制造領域提供了高性能新型加帽酶，也為我國在生物技術領域的國際競爭力增添了砝碼。
SYMPLEX的成功研發(fā)離不開其獨特的研發(fā)思路和強大的技術實力。它將大型語言模型（LLM）與結構化生物知識庫深度融合，開發(fā)出SYMPLEX智能基因挖掘平臺。這一平臺通過自動化閱讀和理解千萬級體量的生物學文獻，在基因、功能和知識水平上提取分析文獻內(nèi)容，并與專家數(shù)據(jù)庫進行概念對齊、交互和基于先進生物信息技術的統(tǒng)計模式生成，提供證據(jù)鏈完整的高質量候選基因集合。此外，平臺還具有自動生成基因功能相關的細粒度知識樹的功能，為科學家探索廣泛的生物機制和分子過程提供了強大的工具。
目前，SYMPLEX在線交互式平臺已上線供研究人員免費使用。該平臺采用模塊化設計，提供了三個核心功能：文獻智能提取引擎PubEngine，支持高通量的文獻智能檢索分析與可視化交互；基因功能標注系統(tǒng)GeneTagger，實現(xiàn)從分子機制到生物過程的細粒度自動化基因與功能提?。粯藴驶R中樞GeneNorm，實現(xiàn)與專家知識庫的概念對齊與標準化，支持知識樹構建和功能模式識別。這些功能為全球科研人員提供了一個高效、便捷的基因挖掘工具，有助于推動基因科學的發(fā)展。
值得一提的是，SYMPLEX的成功研發(fā)和應用不僅對我國科研事業(yè)的發(fā)展起到了推動作用，也對全球生物技術領域產(chǎn)生了深遠影響。它展示了我國在基因科學領域的創(chuàng)新能力和科研實力，也為全球科研人員提供了一個新的研究方向和思路。
總的來說，我國創(chuàng)新基因大模型SYMPLEX引領全球，開啟基因挖掘新時代。這一成果不僅為我國在生物技術領域的國際競爭力增添了砝碼，也為全球科研人員提供了一個高效、便捷的基因挖掘工具，有助于推動基因科學的發(fā)展。我們期待著SYMPLEX在未來能夠取得更多的突破性成果，為人類對生命的探索和認知做出更大的貢獻。
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